目前紫外線殺菌器廣泛應用在生活當中，其中包括生活用水、二次供水、直飲水、純凈水礦泉水廠的殺菌處理，另外像游泳池，景觀水及循環冷卻水的殺菌處理，在工業用水上也起到很大的作用，對食品、化妝、醫藥的那個殺菌處理。在生產中污水排放前也對其進行了殺菌處理。在水產和水族館養殖也對其進行了殺菌保護。